海量数据带来研究压力与挑战

 

南方科技大学（简称南科大），是深圳在国家高等教育改革发展的宏观背景下创建的一所高起点、高定位的公办创新型大学，肩负着为我国高等教育改革发挥先导和示范作用的使命，被誉为“中国高等教育改革试验田”的工科大学。

 

自成立以来，南科大秉持海纳百川的精神，以前沿课题为导向，依托学校的多维度创新机构，聚焦原始创新，为研究生打造实践和检验科研成果的项目平台，在新型物理、材料领域接连取得突破，曾在2017年研发出当时全球准确率最高、唯一针对临床应用的第三代基因测序仪，引中外医学界轰动，其高性能计算之医学研究领域稳居国内前沿和世界一流。当前，随着研究的不断深入，南科大医学院高性能计算方面面临着一些挑战：

 

1、算力不足：基因测序是一个非常复杂的过程，其中包含了基因采样、样本制作、数据下机、生信分析、后基因测序、数据归档等多个环节。对于不同生物信息学程序而言，基于不同算法，其对CPU的要求也不尽相同，但是总体计算量都十分巨大。

 

2、存储需求大：在存储需求量方面，一般人可能无法想象，单个基因组的测量就要处理多达4TB的数据，且在后期基因序列分析时，往往会进行序列对比，这就要求要将海量数据一次性的载入到内存并加以处理，而不适宜分批导入，这就对存储有了非常严苛的容量要求。

 

3、业务量大，拓展成本高：数据长期存储成本高、归档困难，希望存储系统在扩展时，能够同时线性的增加容量以及性能，扩展实施尽量简化，可以在不影响业务的前提下，完成快速部署。

 

可见，南科大医学院HPC集群拓展升级迫在眉睫。经过严格缜密的筛选，宝德依托二十多年的技术积累和在服务器领域的研发实力，量身打造的HPC集群先进解决方案受到南科大科研团队的青睐和认可。

 

用HPC筑底，南科大背后的“宝德”力

 

在接到客户需求后，宝德迅速响应，经过双方团队充分的调研分析、讨论与设计，综合考虑了计算速度和海量存储的需求以及未来技术演进方向下后，最终采用涵盖宝德双路云服务器PR2710P、宝德2U四子星服务器PR2740TP、宝德GS5324D/S v2 统一存储，以及宝德集群管理平台Powercloud等打造的国际领先的高性能计算服务平台。

 

其中，宝德四子星服务器PR2740TP在2U空间里提供超常的吞吐量、存储、网络、I / O、内存和处理能力，帮助客户应对最具挑战性的IT需求，并为客户显著降低总拥有成本(TCO)、增加经济效益；宝德GS5324D/S v2统一存储产品具有高扩展、高性能、高可靠性和最高的性价比，融合当前先进的FC、iSCSI存储标准和技术，专业的企业级磁盘、全面的存储管理以及模块化结构为用户快速、简便和动态响应不断变化的容量和性能要求提供了前所未有的灵活性，它有效整合用户现有存储网络架构，实现高性能NAS/SAN网络的统一部署和集中管理，以适应业务和应用变化的动态需求；

 

尤其值得一提的是宝德双路云服务器PR2710P，采用英特尔®至强®可扩展系列处理器，其高集成度的设计在有限空间内带来强劲的性能表现以支撑关键任务的运行，同时提供先进的管理功能和存储技术，为基因测序而产生数据打造可靠稳定的“容身”空间，让南科大无惧海量数据考验。

 

宝德双路云服务器PR2710P

 

加速基因测序的研究，是惠泽医疗、造福人类的关键，宝德在该领域已有部署，早前牵手华大基因、中国科学院北京生命科学研究院、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所等建立高性能计算集群，为加快国内生物信息科学研究和技术成果的转化进程做出了重要的贡献。今后，宝德将继续发挥HPC集群规划、部署和实施经验，以数据为驱动、以创新为引擎，用强大算力激发数据的磅礴能量，深度赋能生命科学和生物医疗的快速发展。

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